其次，这也意味这公立医院的治理结构不同于国有企业。与国有企业的法人治理结构不同的是，在公益性的总体原则要求之下，公立医院的管理体制、运行机制和监督机制，政府的补偿机制，多元化的办医格局和公立医院的规模、布局等等都需要重新探讨，重新确定。而这每一个环节，都涉及长期以来在“医药不分”的医疗市场化格局中已经固化的利益归属，不是一声令下就能达成目的。

公立医院改革是整个医改方案中最重要，也是最艰难的一环。这一点连温家宝总理也并不讳言。但由于传统体制、政府权力、财政实力的约束，公立医院改革首先就涉及政府和公立医院的关系问题，现在中国的医院和卫生监管部门存在财产、人事等等各种各样的牵连关系，不改革管理公立医院的政府部门，公立医院的改革就是凌虚空蹈。

纵观改革开放以来历程，中国的改革遵循的都是先易后难的路径。容易向困难的递进，其实也就是与权力系统的关系的递进，从企业到事业单位再到政府自身的改革，越接近权力系统的核心，改革就更加复杂，阻力更大，更容易出现胶着和停滞状态。仅从公立医院的改革来看，它的关键所在，已经不是国家投入更多就能解决的问题。